定期清洗以确保出水水质是纯化水日常保养中重要的步骤之一，纯化水清洗分配制清洗液、低流量输入清洗液、循环、浸泡、高流量水泵循环、冲洗六大步骤，清洗液请的配置根据水质情况决定用量多少，一般正规纯化水设备制造商会根据客户水质情况有针对性的配置清洗液，清洗液浸泡时间需严格按照设备操作手册进行，时间不可太久，冲洗时则尽量将时间延长以达到最佳效果，具体操作步奏如下：

1.配制清洗液：将药剂加入洁净的水中，且配制用水必须是去除硬度、不含过度金属和余氯的RO产品水或去离子水。保证溶液要彻底混和均匀，并且把温度和PH调到所需要的值。

2.低流量输入清洗液：首先用清洗水泵混合一遍清洗液，预热清洗液时应以低流量。然后以尽可能低的清洗液压力置换元件内的原水，其压力仅需达到足以补充进水至浓水的压力损失即可，即压力必须低到不会产生明显的渗透产水。低压置换操作能够最大限度的减低污垢再次沉淀到膜表面，视情况而定，排放部分浓水以防止清洗液稀释。

3.循环：当原水被置换掉后，浓水管路中就应该出现清洗液，让清洗液循环回清洗水箱并保证清洗液温度恒定。

4.浸泡：停止清洗泵的运行，让膜元件完全浸泡在清洗液中。有时元件浸泡1小时就足够了，但对于顽固的污染物，需要延长浸泡时间，如浸泡10～15小时或浸泡过夜。为了维持浸泡过程的温度，可采用很低的循环流量（约为表１所示流量的10%）。

5、高流量水泵循环：按表１所列的流量循环30～60分钟。高流量能冲洗掉被清洗液洗下来的污染物。如果污染严重，请采用高于表１所规定的50%的流量将有助于清洗，在高流量条件下，将会出现过高压降的问题，单元件最大允许的压降为１bar(15psi)，对多元件压力容器最大允许压降为3.5bar(50psi)，以先超出为限。

6、冲洗：用清洁水（去除硬度、不含金属离子如铁和氯的RO产品水或去离子水）进行低压冲洗，冲洗系统内的清洗液可以用预处理的合格产水，除非存在腐蚀问题。为了防止沉淀，最低冲洗温度为20摄氏度。